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生命學(xué)院團(tuán)隊揭秘植物如何感受“生命之重”

2024.09.05

    文字

    陶天野


    圖片設(shè)計

    韓羽臻


    資料提供

    科研院  生命學(xué)院


    編審

    劉蔚如  周襄楠

    張歌明  張莉

    李萍


    欄目統(tǒng)籌

    周襄楠  賀茂藤

主樓旁高大的雪松,、學(xué)堂路上成排的加楊和圓柏,、荷塘中亭亭玉立的荷花……我們在清華園中穿行時,享受著樹木枝椏密葉下的陰涼,,欣賞著花草的五彩繽紛,,但目力所及的所有植物為何總是向下扎根,、向上生長?

一般情況下,,對于一株植物而言,,不管被如何旋轉(zhuǎn)或者是塑形,它的根總會朝向地心生長,,而莖則努力向上尋找陽光,,這種現(xiàn)象被稱為植物的重力感應(yīng)。

為什么會有這個現(xiàn)象,,它是怎么發(fā)生的,?這個問題讓科學(xué)家們追問了超過兩百年。早在1806年,托馬斯·安德魯·奈特證明了重力指導(dǎo)著植物器官的生長方向,。緊接著,,此后的一個世紀(jì)里先后出現(xiàn)了兩項重要成果:進(jìn)化論的奠基人查爾斯·羅伯特·達(dá)爾文將植物根部感受重力方向的區(qū)域具體到了根尖;20世紀(jì)初的“淀粉-平衡石”假說則在“細(xì)胞內(nèi)淀粉體沉降”這一生物現(xiàn)象和“觸發(fā)重力感應(yīng)信號”的結(jié)論間建立起了假設(shè)性聯(lián)系,。

而生命科學(xué)探索并未止步于此,,隨著分子生物學(xué)和基因技術(shù)的發(fā)展,科學(xué)家們開始致力于揭示植物感應(yīng)重力的分子機(jī)制,。從細(xì)胞層面到分子層面,,就如從一場戲劇的前臺走入后臺,去深入了解構(gòu)成劇目的每一部分如何運(yùn)作和串聯(lián),。

清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院副教授陳浩東正是眾多“走入后臺”的科學(xué)家中的一員,。2023年,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,、清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心陳浩東團(tuán)隊發(fā)表于《細(xì)胞》(Cell)期刊的研究論文“植物中淀粉體沉降重新極性化LAZYs實(shí)現(xiàn)重力感受”(Amyloplast sedimentation repolarizes LAZYs to achieve gravity sensing in plants),,為“植物感受重力過程中的分子機(jī)制”這個跨世紀(jì)的科學(xué)難題提供了關(guān)鍵答案。該成果入選2023年清華大學(xué)最受師生關(guān)注的年度亮點(diǎn)成果,?!蹲匀弧罚?em>Nature)等眾多國際國內(nèi)學(xué)術(shù)期刊對該論文進(jìn)行了亮點(diǎn)評述,認(rèn)為該成果“引人入勝”,,是“植物重力感應(yīng)領(lǐng)域具有里程碑意義的工作”,。

陳浩東(左)指導(dǎo)學(xué)生做實(shí)驗

在陳浩東團(tuán)隊給出的答案中,一個不容忽視的角色是LAZY蛋白,。早在1931年與1938年,,lazy突變體就分別在玉米與水稻中被篩選到。這些突變體的地上部分相比于野生型更多地偏離豎直方向,,呈現(xiàn)“慵懶”狀態(tài),,因而得名。直到2007年,,LAZY基因才被成功鑒定,,中國與日本科學(xué)家同期在水稻中鑒定到了LAZY1基因。此后,,該基因家族被發(fā)現(xiàn)廣泛參與擬南芥,、玉米、苜蓿,、李子樹,、百脈根等多種物種中的向重力性調(diào)控,并且同時參與植物地上與地下部分的向重力性調(diào)控,。陳浩東團(tuán)隊通過對擬南芥進(jìn)行基因編輯和遺傳回補(bǔ)實(shí)驗,,證實(shí)了LAZY2LAZY3LAZY4這三個基因?qū)τ谥参锔恼蛑亓π允潜匦璧?。接著,,他們又發(fā)現(xiàn)LAZY蛋白定位在根尖柱細(xì)胞(也就是感受重力的細(xì)胞)的細(xì)胞膜和淀粉體膜上,并且在細(xì)胞膜上的定位呈現(xiàn)下側(cè)多上側(cè)少的極性,,從位置上直接表現(xiàn)出強(qiáng)烈的“指地針”屬性,。“此時,,我們對LAZY蛋白的認(rèn)識一下就提升了,,下一步就是看它們具體如何轉(zhuǎn)移與執(zhí)行功能?!标惡茤|說,。

植物根尖向下生長,并不像之前人們想象的因細(xì)胞中淀粉體的重量產(chǎn)生了向下拉扯或壓力,,而是LAZY蛋白結(jié)合到淀粉體表面上并隨著淀粉體的沉降產(chǎn)生了位移,,陳浩東形象地稱之為“船載貨行”。當(dāng)植物偏離重力方向時,,MKK5-MPK3蛋白激酶模塊與LAZY蛋白的相互作用增強(qiáng),,導(dǎo)致LAZY蛋白磷酸化程度增加,LAZY蛋白獲得磷酸化這張“船票”后與淀粉體表面的TOC34/120/132蛋白的相互作用增強(qiáng),,并作為“貨物”隨著“船只”淀粉體沉降到細(xì)胞新的底部,。此過程中,LAZY蛋白如同乘坐航船在海浪中行進(jìn),,并在淀粉體沉降到細(xì)胞新底部后,,逐漸離開“船只”聚集到新的下側(cè)細(xì)胞膜上,而后指導(dǎo)了生長素的不對稱分布,,從而引發(fā)植物的向重力性生長反應(yīng)。當(dāng)植物根尖重新沿著重力方向豎直向下生長時,,LAZY蛋白就會失去“船票”回歸到初始狀態(tài),。

植物根尖感受重力的模型

這個機(jī)制中環(huán)環(huán)相扣的每一步都建立在縝密的邏輯推理和實(shí)驗論證基礎(chǔ)上,其中甚至離不開研究者大膽的推演,。LAZY基因在2007年就被學(xué)界鑒定到,,淀粉體上的TOC蛋白在2009年被報道參與植物的向重力性,但在過去十多年的時間里,,二者只是獨(dú)立存在的科學(xué)事實(shí),,并沒有被聯(lián)系在一起。直到陳浩東團(tuán)隊通過細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗觀察到LAZY蛋白出現(xiàn)在淀粉體表面,,他們大膽地推測二者之間或許存在直接相互作用,。在這種思路的啟發(fā)下,經(jīng)過一系列實(shí)驗和驗證,他們成功揭示了植物感受重力的分子機(jī)制,,為120年前提出的“淀粉-平衡石”假說提供了分子解釋,。

對科學(xué)難題的揭秘,挑戰(zhàn)無處不在,。LAZY蛋白本身含量就很少,,更何況磷酸化只是它表面一種很小的修飾,這種修飾又是不穩(wěn)定,、容易消失的,,因此“如何能可靠地檢測到磷酸化”便成了很大的難題。在利用顯微鏡觀察LAZY蛋白在細(xì)胞中的定位時,,既要求LAZY-GFP蛋白(即融合了熒光蛋白的LAZY)達(dá)到足夠的量以便能被觀察到,,又要求其量不能過多,以免掩蓋可能出現(xiàn)的極性分布變化,。面對種種挑戰(zhàn),,陳浩東團(tuán)隊成員精誠合作,通過努力為一個又一個難題找到了解決方案,,并綜合多方面數(shù)據(jù)來提出最合理的假設(shè),。此過程不僅需要深刻思考,更需要做決策的勇氣,。

陳浩東將做研究的過程比喻為“盲人摸象”,。植物感受重力的分子機(jī)制是一個極其復(fù)雜且未知的領(lǐng)域,科學(xué)家們無法一開始就看到整個機(jī)制的全貌,,只能通過一個個微小的實(shí)驗逐步摸索,。只有把所有的結(jié)果綜合起來,才能最終拼湊出完整的科學(xué)圖景,?!暗矸垠w沉降、LAZY蛋白,、TOC蛋白,、激酶……我們做的最重要的事情就是通過生化、細(xì)胞,、遺傳等實(shí)驗把這些因子之間的聯(lián)系全面建立起來,。”

揭示植物感受重力的分子機(jī)制,,不僅深化了對植物生長機(jī)制的理解,,而且可以在現(xiàn)實(shí)中指導(dǎo)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、太空育種等,,為生態(tài)環(huán)境維護(hù)和人類發(fā)展發(fā)揮關(guān)鍵作用,。

近150年前,,達(dá)爾文切除了植物的根尖并把植物橫向放置,發(fā)現(xiàn)它們沒有辦法再向下彎曲生長,,由此他確定了植物根部感受重力的部位是根尖,。通過進(jìn)一步的實(shí)驗,他發(fā)現(xiàn)有物質(zhì)(后來被確定為生長素)可以從根尖向伸長區(qū)傳遞,,驅(qū)動彎曲生長,。在《植物的運(yùn)動本領(lǐng)》(The Power of Movement in Plants)這本書中,他詳盡地記錄下了整個實(shí)驗過程與結(jié)果,。陳浩東熟練地從書架取下那本厚厚的《植物的運(yùn)動本領(lǐng)》,,翻到對應(yīng)的頁面,指給記者看并說:“直到現(xiàn)在,,我們的研究還沒有跳出他給出的理論框架,。”然而,,LAZY蛋白為何會在植物相對重力方向改變時增強(qiáng)磷酸化,?植物中是否還存在其它感知重力的方式?從細(xì)胞極性到植物器官向性生長之間的信號傳遞過程是怎樣的,?在這個領(lǐng)域中,,仍有一系列的未知等待著人類去探索與揭秘。

陳浩東課題組2024年合影

2023年在《細(xì)胞》發(fā)表的這篇揭示植物感受重力分子機(jī)制的論文已在領(lǐng)域內(nèi)產(chǎn)生了廣泛影響,,該成果是團(tuán)隊成員精誠協(xié)作,、努力拼搏取得的。陳浩東為論文通訊作者,,其團(tuán)隊成員陳家悅,、于仁波、李娜,、鄧兆國,、張欣欣、趙亞冉,、曲城甫為論文共同第一作者,;袁艷芳、潘哲賢,、周楊楊,、李昆侖,、汪加軍,、陳之忍、王笑一,、王笑連,、賀舒楠為參與作者,。北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院及北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院鄧興旺教授、美國新澤西州立羅格斯大學(xué)董娟教授為研究作出了重要貢獻(xiàn),。


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