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李梢課題組發(fā)現(xiàn)胃癌極早期標(biāo)志物:“英雄”莫問出處

2019.06.21

    素材提供

    自動化系

     

    文字采寫
    楊鵬成


    圖片設(shè)計

    趙存存

     

    編審
    盧小兵   程曦
    張歌明   張莉
     
    欄目統(tǒng)籌
    程曦

“大家總是拿中醫(yī)和西醫(yī)作比較,,我覺得不管中醫(yī)還是西醫(yī),關(guān)鍵是能夠治病救人,。”當(dāng)清華大學(xué)自動化系教授,、清華信息科學(xué)與技術(shù)國家實驗室中醫(yī)藥交叉研究中心主任李梢被問及此類問題時,他這樣提出自己的觀點,。“這就像我的課題組一樣,,雖然學(xué)生的專業(yè)背景不同,但英雄不問出處,,大家齊心協(xié)力,,以解決問題為首要目的。”

今年5月,,李梢課題組又解決了一個難題——以課題組博士生張鵬為第一作者的論文《解析胃癌前病變和早期胃癌的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組網(wǎng)絡(luò)》作為長文發(fā)表在國際著名學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》的子刊《細(xì)胞報告》(Cell Reports)上,。該研究通過胃炎和胃早癌患者單細(xì)胞測序,首次成功捕捉胃癌發(fā)生的單細(xì)胞微弱信號及其網(wǎng)絡(luò)關(guān)聯(lián),,突破性地發(fā)現(xiàn)了胃癌極早期細(xì)胞標(biāo)志物,,在胃炎癌轉(zhuǎn)化單細(xì)胞機制和極早期診斷方面取得重大進展。“這就相當(dāng)于我們?nèi)プタ植婪肿?,等恐怖事件發(fā)生后才抓到就晚了,,我們要事先找到與恐怖分子相關(guān)的人并一網(wǎng)打盡,防止事態(tài)發(fā)生,。”李梢打了個生動的比方,。

李梢1999年就提出了中醫(yī)藥和生物分子網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的假說。隨后,他將傳統(tǒng)中醫(yī)診斷描述和統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)(UMLS)相結(jié)合,,對中醫(yī)診斷進行標(biāo)準(zhǔn)化描述,。基于此,,建立了從整體上銜接“疾病表型”與患者“基因型”兩個生物網(wǎng)絡(luò)之間的計算模型,。通過對這一模型的深入探索,李梢課題組以胃癌的中西醫(yī)防治為范例,,從“表型-細(xì)胞-分子”多層次生物網(wǎng)絡(luò)的角度揭示了胃炎癌轉(zhuǎn)化的內(nèi)在機制,,發(fā)現(xiàn)了胃癌極早期標(biāo)志物和能夠抑制胃炎癌轉(zhuǎn)化的中藥成分。

作為中醫(yī)藥學(xué)和生物信息學(xué)的交叉學(xué)科,,李梢課題組的學(xué)生涵蓋了自動化,、計算機、生物醫(yī)藥,、中醫(yī)藥等不同的專業(yè)背景,。大家雖然專業(yè)不同,但是都有著治病救人的共同愿景,;雖然各有專攻,,但都會親自參與臨床觀察和采樣、學(xué)習(xí)相關(guān)的醫(yī)學(xué)藥學(xué)知識,。“別人覺得有困難的地方,,我們才要堅持做下去,不然何談創(chuàng)新,?”在有關(guān)胃炎和胃癌的研究中,,課題組需要對比觀察正常人、胃炎和胃癌患者不同階段的胃部細(xì)胞,,當(dāng)最初找不到正常人的胃部組織樣本時,,課題組的博士生還主動提出做胃鏡、用自己的樣本來做實驗,。這種追求卓越,、勇于奉獻的精神正是課題組能夠解決一個又一個難題的法寶。

出生在中醫(yī)藥世家的李梢從本科到博士都是主攻中醫(yī)藥專業(yè),,在接觸臨床知識與訓(xùn)練的過程中,他逐漸認(rèn)識到當(dāng)前醫(yī)療手段的欠缺,、醫(yī)學(xué)對基礎(chǔ)科研的迫切需求以及中醫(yī)藥在現(xiàn)代的發(fā)展困境,。因此2001年博士畢業(yè)后,他來到清華大學(xué)自動化系做李衍達院士的博士后,,在李院士的支持下,,率先開展生物信息學(xué)與中醫(yī)藥現(xiàn)代化大跨度交叉學(xué)科研究。李稍選擇當(dāng)時剛剛出現(xiàn)的生物信息學(xué)作為自己的主要方向,是因為中醫(yī)“重視整體”的內(nèi)在邏輯與生物信息學(xué)的基本原理是契合的,。中醫(yī)面臨的問題需要用生物信息學(xué)的方法解決,,而自動化領(lǐng)域內(nèi)信息論的發(fā)展又要與實際的問題相結(jié)合。

中醫(yī)強調(diào)整體觀,,將一個整體拆成一個個零件是相對容易的,,而將一個個零件重新組合成一個整體,尤其是組合人體這么復(fù)雜的生物系統(tǒng),,則要困難得多,。但中醫(yī)診斷和治療過程將人體作為一個“黑箱”看待,對于黑箱的內(nèi)部原理缺少證明的方法,,中醫(yī)藥理論也與近代生物學(xué)“從基因到性狀”的基本研究方法和理論存在隔閡,。而生物信息學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)等新方法的出現(xiàn),,則為中醫(yī)藥研究帶來了理解其整體性質(zhì)的希望,;中醫(yī)藥的整體特色,又為前沿科技的發(fā)展和突破提供了豐富的資源,。通過學(xué)科交叉,,李梢教授課題組還相繼開拓了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、中醫(yī)藥人工智能等新方向,,不僅有助于推動中醫(yī)藥現(xiàn)代化,,也為開發(fā)新的疾病診療方法提供了全新的研究思路。

2014年11月4日,,美國《華爾街日報》用兩個版面刊發(fā)了題為“古老療法的新資料”的長篇報道,,突出介紹了李梢課題組在中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)方向上的有關(guān)成果,即通過建立復(fù)雜生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析方法,,發(fā)現(xiàn)慢性胃炎典型寒證,、熱證患者代謝與免疫分子網(wǎng)絡(luò)失衡的特征、相關(guān)生物標(biāo)志物和舌苔差異菌群,,突破了中醫(yī)客觀化,、微觀化的難點,為中醫(yī)藥個體化診療提供了科學(xué)證據(jù),,為科學(xué)理解中醫(yī)藥特色內(nèi)涵提供了一條新途徑,。

正如李梢的博士生導(dǎo)師王永炎院士所言,中醫(yī)現(xiàn)在處于“乍暖還寒”時候,,雖然國家大力鼓勵傳承和創(chuàng)新,,但是中醫(yī)在科學(xué)上的瓶頸還沒有得到根本上的突破——如何解釋復(fù)雜的中醫(yī)藥、復(fù)雜的生命系統(tǒng)等,,這些都還不清楚,,中醫(yī)的傳承與創(chuàng)新仍需付出巨大的努力。“中醫(yī)藥缺乏符合自身整體特色的科學(xué)研究方法,這是一個發(fā)展困境,。難題如何解決呢,?亟需找到新理論、新方法,。只有真正維護人類健康,,為醫(yī)療、科技和社會發(fā)展作出貢獻,,中醫(yī)藥才會更好地被大家認(rèn)可和接受,,挑戰(zhàn)才能轉(zhuǎn)變成機遇,中醫(yī)藥才會發(fā)展得越來越好,。”在這條道路上,,李稍和他的團隊還將繼續(xù)創(chuàng)新求索。


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