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藥學(xué)院與生命學(xué)院合作解析機(jī)械力受體PIEZO1的結(jié)構(gòu)功能機(jī)制

清華新聞網(wǎng)12月26日電 近日,清華大學(xué)藥學(xué)院肖百龍教授課題組,、生命學(xué)院李雪明研究員課題組與藥學(xué)院田博學(xué)研究員課題組合作,,解析了機(jī)械力受體PIEZO1的中間開放狀態(tài)的結(jié)構(gòu),,揭示了其精細(xì)結(jié)構(gòu)動態(tài)變化和門控轉(zhuǎn)換過程,并結(jié)合結(jié)構(gòu)分析,、分子動力學(xué)模擬和電生理實(shí)驗(yàn),,定義了其關(guān)閉態(tài)、開放態(tài)和失活態(tài)的不同構(gòu)象狀態(tài),,提出了其門控循環(huán)機(jī)制,,完善了其曲率感知理論學(xué)說。

PIEZO是一類專門的機(jī)械力受體,,具有將多種形式的機(jī)械刺激轉(zhuǎn)導(dǎo)成陽離子內(nèi)流的能力,。PIEZO蛋白憑借其納米尺度的曲率形變,能夠感受皮牛尺度的力,,并在毫秒尺度被激活,,隨后快速失活。這種出色的機(jī)械敏感性使得PIEZO蛋白在多種細(xì)胞中發(fā)揮重要的機(jī)械信號轉(zhuǎn)導(dǎo)功能,,進(jìn)而調(diào)控了觸覺,、本體感覺,、機(jī)械痛癢覺,、血壓、心率等眾多生理過程,。PIEZO蛋白在受力時可以從關(guān)閉狀態(tài)迅速轉(zhuǎn)換至開放狀態(tài),,隨后快速進(jìn)入失活狀態(tài)。PIEZO蛋白的精細(xì)門控調(diào)節(jié)可能對應(yīng)著其發(fā)揮的廣泛生理和病理作用,。例如,,在體內(nèi)一些細(xì)胞類型中,內(nèi)源的PIEZO1介導(dǎo)電流的失活速度相較于異源表達(dá)的PIEZO1顯著減慢,;PIEZO1的一些功能獲得性突變的人類致病位點(diǎn)往往具有電流失活變慢的特點(diǎn),。因此,確定PIEZO不同功能狀態(tài)的結(jié)構(gòu)對于在分子層面上深入理解其門控過程至關(guān)重要,。

肖百龍課題組和李雪明課題組先前的研究揭示了PIEZO蛋白以同源三聚體的形式組成三葉螺旋槳樣結(jié)構(gòu),,帶有帽子結(jié)構(gòu)(Cap)的離子孔道位于三聚體中央。在先前使用去垢劑解析的PIEZO1結(jié)構(gòu)中,,三個槳葉(Blade)高度彎曲成碗狀,,稱之為“納米碗”,此時帽子結(jié)構(gòu)處于向上位置且帽子門(Cap-gate)關(guān)閉,,與帽子門相連的彈簧連接器(Spring-linker)處于放松狀態(tài),,離子孔道的疏水跨膜孔徑較小且被認(rèn)為處于關(guān)閉狀態(tài),無法浸潤和滲透離子,,細(xì)胞內(nèi)側(cè)的杠桿結(jié)構(gòu)(Beam)沒有彎折,,側(cè)向門塞(Lateral plug)也被堵塞,。這類彎曲的構(gòu)象有可能代表PIEZO1的關(guān)閉構(gòu)象(圖1上)。

在利用脂質(zhì)體-膜蛋白重組體系,,引入由質(zhì)膜與重組蛋白曲率差異而產(chǎn)生的作用力后,,研究者進(jìn)一步解析出了PIEZO1蛋白的受力展平構(gòu)象,此時槳葉完全被壓平,,同時帽子結(jié)構(gòu)處于向上位置且帽子門關(guān)閉,,彈簧連接器處于放松狀態(tài),跨膜孔道部分?jǐn)U張,,細(xì)胞內(nèi)側(cè)的杠桿結(jié)構(gòu)彎折,,側(cè)向門塞處于堵塞狀態(tài)。鑒于此結(jié)構(gòu)下PIEZO1蛋白持續(xù)受力,,因此該展平構(gòu)象很可能處于失活狀態(tài)(圖1下),。

PIEZO通道毫秒尺度的動力學(xué)特征使其難以穩(wěn)定在開放狀態(tài),因此對于解析其開放狀態(tài)結(jié)構(gòu)帶來了非常大的挑戰(zhàn),。該研究首先鑒定到一個位于離子孔道疏水跨膜區(qū)的點(diǎn)突變PIEZO1-S2472E,,其電生理特性表現(xiàn)出更高的自發(fā)開放電流和更慢的電流失活速度,提示PIEZO1-S2472E突變體可能通過減緩PIEZO1向失活狀態(tài)的轉(zhuǎn)變而穩(wěn)定在開放狀態(tài),。研究者克服了PIEZO1-S2472E蛋白純化得率低的難題,,使用冷凍電鏡解析出其三類構(gòu)象狀態(tài)的結(jié)構(gòu)。第一類構(gòu)象與PIEZO1彎曲結(jié)構(gòu)類似,,被稱為S2472E-Curved,;第二類構(gòu)象的槳葉區(qū)高度介于彎曲構(gòu)象和展平構(gòu)象之間,帽子結(jié)構(gòu)域處于向下位置,,被稱為S2472E-Intermediate,,代表中間開放構(gòu)象狀態(tài);第三類構(gòu)象的槳葉區(qū)被完全壓平,,且帽子結(jié)構(gòu)處于向下位置,,被稱為S2472E-Flattened,可能代表完全開放構(gòu)象狀態(tài),,但該類別占比較低,,分辨率難以提高。

研究者重點(diǎn)分析了S2472E-Intermediate構(gòu)象,,其槳葉區(qū)部分展平,,槳葉高度介于關(guān)閉態(tài)和失活態(tài)之間,胞外帽子發(fā)生旋轉(zhuǎn)且向下移動,,進(jìn)而壓縮了下方相連的彈簧連接器,,帽子門和疏水跨膜門被打開,胞內(nèi)側(cè)的杠桿結(jié)構(gòu)發(fā)生一定程度的彎折,,然而此時側(cè)向門塞仍然保持堵塞,。結(jié)合分子動力學(xué)模擬,,研究者認(rèn)為此構(gòu)象處于中間開放狀態(tài)(圖1中)。

圖1.PIEZO1關(guān)閉,、中間開放與失活的結(jié)構(gòu)機(jī)制示意圖

綜合對PIEZO1和PIEZO1-S2472E系列結(jié)構(gòu)的分析,、突變和電生理學(xué)實(shí)驗(yàn)以及分子動力學(xué)模擬等證據(jù),研究者定義了PIEZO1的關(guān)閉狀態(tài),、中間開放狀態(tài)和失活狀態(tài)的結(jié)構(gòu)特征,,完善了PIEZO1的形變與曲率門控模型(圖2)。

A.PIEZO1-Curved和S2472E-Curved結(jié)構(gòu)代表PIEZO1的關(guān)閉狀態(tài),,此時PIEZO1槳葉區(qū)呈高度彎曲狀,,PIEZO1納米碗曲率半徑約為10至14nm,帽子在向上位置且全部門控位點(diǎn)關(guān)閉,。

B.S2472E-Intermediate結(jié)構(gòu)代表PIEZO1的中間開放狀態(tài),,此時帽子在向下位置且發(fā)生旋轉(zhuǎn),槳葉區(qū)部分下壓,,曲率半徑約為32nm,,杠桿結(jié)構(gòu)發(fā)生部分彎折,帽子門和跨膜門打開,,離子能滲透通過中心孔道,,但側(cè)塞門仍然保持關(guān)閉。

C.在研究者預(yù)測的開放狀態(tài)S2472E-Flattened中,,帽子仍處在向下位置,,槳葉區(qū)徹底展平,,包括側(cè)塞門在內(nèi)的所有門控位點(diǎn)全部打開,。

D.PIEZO1-Flattened結(jié)構(gòu)代表PIEZO1的失活態(tài),此時槳葉區(qū)依舊保持展平,,曲率半徑約為117nm,,但帽子位于向上位置,彈簧連接器舒展,,各個門控逐步關(guān)閉,。

圖2.PIEZO1的形變與曲率門控模型

相關(guān)研究成果以“中間開放態(tài)結(jié)構(gòu)揭示機(jī)械激活PIEZO1通道的門控轉(zhuǎn)換”(An intermediate open structure reveals the gating transition of the mechanically activated PIEZO1 channel)為題,于12月23日發(fā)表于《神經(jīng)元》(Neuron),。

肖百龍教授,、李雪明研究員和田博學(xué)研究員為論文的共同通訊作者,李雪明課題組已畢業(yè)博士生劉斯嘉,、肖百龍課題組已畢業(yè)博士生楊旭中,、肖百龍課題組2021級博士生陳旭東、田博學(xué)課題組2020級博士生張孝春和肖百龍課題組已畢業(yè)博士生姜京徽為共同第一作者,。另外,,肖百龍課題組的原靜怡博士,、劉文豪博士、王莉博士,、吳坤博士和李雪明課題組的周珩博士也參與了部分工作,。

研究得到國家科技部2030科技創(chuàng)新-“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目,新基石研究員項(xiàng)目,,北京市卓越學(xué)者項(xiàng)目,,深圳市醫(yī)學(xué)研究專項(xiàng),清華大學(xué)萬科公共衛(wèi)生學(xué)院研究基金等項(xiàng)目的經(jīng)費(fèi)支持,,清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心,、北京結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心、膜生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,、清華大學(xué)蛋白質(zhì)科學(xué)技術(shù)中心蛋白質(zhì)制備與鑒定實(shí)驗(yàn)室為本研究提供了經(jīng)費(fèi)或設(shè)施支持,。

論文鏈接:

https://www.cell.com/neuron/abstract/S0896-6273(24)00877-8

供稿:藥學(xué)院

編輯:李華山

審核:郭玲

2024年12月26日 14:31:30

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